Link tarafından maceraları boyunca toplanan nesneler oyunda önemli bir yer tutuyor (çoğu önceki bölümlerde de bulunuyordu). Birçok yararlı malzeme bulunmakta: Teleskoplar, bir kanca, değişik iksirlerle doldurulabilen boş şişeler ve bulduğunuz ve satıcılardan aldığınız malzemeleri içinde taşıyabileceğiniz çuvallar. Para ise sandık, kırılan fıçılar, vazolar ve diğer nesnelerin içlerini araştırarak topladığınız renkli mücevherler ile temsil ediliyor.
Ayrıca uzun otları kılıcınızla keserek veya düşmanlarınızı yenerek de para kazanabilirsiniz. Bazı nesnelerin büyük düşmanları yenmekte vazgeçilmez bir değere sahip olduğunu ve bazılarının ise oyunda sadece ilerlemenize yaradığını göreceksiniz. Bunlar içinde pusula ve haritaları sayabiliriz. 3 çeşit harita bulunmakta: Kale haritaları, hazine haritaları ve sahip olmadan adaların yerlerini bulamayacağınız ada haritaları. Bu nesnelerin çoğu oyunun başka yönlerini açan anahtar gibi de diyebiliriz.
Nesneler oyunda büyük bir rol oynuyor. Bazılarının birkaç fonksiyonu bulunmakta. Rüzgar yaratmak için ve bir "delta kanat" olarak kullanabileceğiniz mojo yaprağı gibi.
Rüzgar yüzüğü, testleri geçmenize yarayacak bir etki yaratan ezgiler bestelemenize olanak verecek. Uzman bir konsol oyuncusu değil iseniz, oyunu öğrenmenizi de sağlayacak. Fakat oyundaki en orijinal nesne Tingle Tuner. Tingle maceranın başlarında tanışacağınız uçuk hafızalı bir elf. Bu araç, gerekli kabloya sahip olmanız durumunda Game Boy Advence'inizi GameCube'a bağlamanıza olanak veriyor. Eğer GameCube'unuz yoksa bu sizi tabii ki oyunu oynamak ve Zelda'yı bitirmekten alıkoymuyor. Tingle Tuner'ınızı küçük elf'ten yardım istemek için kullanabilirsiniz. Böylece GBA'de civar bölgelerin haritasıyla beraber görünecektir. Bu denizlerin epey doğru bir haritasını içermesinin yanında, bilmeceleri çözmenizde de yardımcı olacak. Tingle ayrıca sizinle ilgileniyor, size özel bombalar gönderebiliyor, hatta bazen uçmanızı bile sağlayabiliyor. Tabii bu da size birkaç mücevhere mal olacak.
Joystick üzerindeki X, Y ve Z butonları Link'in bulmuş olduğu uzun yaşam, uzun görüş, denize açılma, rüzgar yüzüğü vs. gibi nesneler için kullanılabilir.