Her görev eksiksiz bir brifing ile başlıyor; ardından altışar kişilik iki takımdan oluşan birliklerinizi hazırlamaya başlıyorsunuz. Bu seviyede, Ghost Recon'un konsol sürümü PCV sürümünden biraz farklı bir yol izliyor. PC sürümünde iki askerli üç takım oluşturmanız mümkün. Biriminizin her üyesinin kendine özgü nitelikleri var ve bu nitelikler her görevde gelişiyor. Dolayısıyla her operasyonda ne kadar az adam kaybederseniz, uzun vadede o kadar güçlü oluyorlar. Ekipmana gelince, tabancadan roket-atara 20'yi aşkın silah içeren bir cephaneliğiniz var. Buna "Objective Individual Combat Weapon (OICW)" gibi yeni genel silahlar da dahil. Ancak bir şeye dikkat: Her asker sadece iki silah taşıyabildiği için silajların mümkün olduğunca efektif şekilde, askerlerin becerilerine göre dağıtılması gerekiyor. Rainbow Six serisindeki oyunların asline önceden bir görev planınız olmuyor. Bu durumda tüm komutlar sahada, gerçek zamanlı olarak veriliyor. İstediğiniz an bir askerden diğerine geçip o askeri yönetebilirsiniz.
